Hikâye bir seri cinayet olayının yaşandığı bir ortaokulda geçiyor. Bu okula giden Kobayashi isimli öğrenci, Akechi isimli, okuldaki olan olayları incelemeye gelen gizemli bir dedektif ile karşılaşır. Kobayashi, arkadaşı Hashiba’nın uyarılarına rağmen Akechi’nin gizemli dünyasına ilgi duyar ve onun asistanı olmaya karar verir.